Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SNCBQ16143 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SNCBQ16143 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNCBQ16143 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SNCBQ16143 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SNCBQ16143 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNCBQ16143 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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