Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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