Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRADDQ15628 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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