Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TLR1Q15399 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TLR1Q15399 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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