Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
R3HDM1Q15032 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
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