Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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