Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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COL4A6Q14031 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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