Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1SQ13698 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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