Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CDH18Q13634 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CDH18Q13634 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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