Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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