Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSLNQ13421 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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