Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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UBE2V1Q13404 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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