Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE3BQ13370 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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