Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SGCGQ13326 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCGQ13326 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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