Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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