Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF1Q13077 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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