Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXF1Q12946 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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