Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms