Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms