Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR4Q05215 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms