Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms