Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YPR170CYPR170C 336 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 IRC10YOL015W 1761 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 MET18YIL128W 3099 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 HER1YOR227W 3741 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 UBC5YDR059C 447 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 GIM5YML094W 492 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YMR144WYMR144W 1029 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 MIX23YBL107C 591 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 ARL3YPL051W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YBR062CYBR062C 543 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YPR147CYPR147C 915 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 KAP123YER110C 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 KIP1YBL063W 3336 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 CTF13YMR094W 1437 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RTT107YHR154W 3213 nt2.06□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RBK1YCR036W 1002 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RPS16AYMR143W 432 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 PAI3YMR174C 207 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 COA6YMR244C-A 315 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 TRM7YBR061C 933 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RTT101YJL047C 2529 nt2.05□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 IPT1YDR072C 1584 nt2.04□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 NCB2YDR397C 441 nt2.04□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RUD3YOR216C 1455 nt2.04□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 BUD2YKL092C 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 SHS1YDL225W 1656 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 ARP7YPR034W 1434 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 SSF1YHR066W 1362 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 COX8YLR395C 237 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YNR025CYNR025C 360 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 snR189snR189 189 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 VID24YBR105C 1089 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 RRP6YOR001W 2202 nt2.03□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 TRM3YDL112W 4311 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 USO1YDL058W 5373 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YDR018CYDR018C 1191 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 GPI8YDR331W 1236 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 RPS26BYER131W 360 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 PRP38YGR075C 729 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 PRP21YJL203W 843 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YJR087WYJR087W 351 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YNR021WYNR021W 1215 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YPR153WYPR153W 423 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 MMS22YLR320W 4365 nt2.02□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ATG9YDL149W 2994 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 snR59snR59 78 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 DAD1YDR016C 285 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 TDA2YER071C 381 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YFR056CYFR056C 369 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 RRF1YHR038W 693 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SDL1YIL167W 633 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ACF4YJR083C 930 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SRP21YKL122C 504 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 PDP3YLR455W 915 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SFM1YOR021C 642 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 VPH1YOR270C 2523 nt2.01□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 snR9snR9 187 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 Q0144Q0144 330 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YLR379WYLR379W 375 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ARR2YPR200C 393 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ECM25YJL201W 1800 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 BRR2YER172C 6492 nt2□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 TMA20YER007C-A 546 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 VPS8YAL002W 3825 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ECM9YKR004C 1134 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ATG38YLR211C 681 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YLR271WYLR271W 825 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 GIM3YNL153C 390 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YOL029CYOL029C 606 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YOR169CYOR169C 465 nt1.99□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SAC3YDR159W 3906 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 BUD19YJL188C 309 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ERG29YMR134W 714 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SWM2YNR004W 441 nt1.98□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 PDR8YLR266C 2106 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 ASG1YIL130W 2895 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YJL070CYJL070C 2667 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 FAR7YFR008W 666 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YJL086CYJL086C 369 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SHE2YKL130C 741 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 YKR051WYKR051W 1257 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 VPS63YLR261C 327 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 RIO2YNL207W 1278 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 NIC96YFR002W 2520 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 REV1YOR346W 2958 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 SNF12YNR023W 1701 nt1.97□□□□□ -2.09
CSI1Q04368 TRL1YJL087C 2484 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YDR029WYDR029W 315 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 FMP16YDR070C 282 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YDR199WYDR199W 366 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YGL042CYGL042C 306 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YHR054CYHR054C 1065 nt1.96□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 SHE4YOR035C 2370 nt1.95□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.95□□□□□ -2.1
CSI1Q04368 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.95□□□□□ -2.1
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