Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms