Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms