Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms