Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA5Q01523 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA5Q01523 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms