Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms