Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFI35P80217 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFI35P80217 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFI35P80217 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFI35P80217 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFI35P80217 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFI35P80217 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFI35P80217 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFI35P80217 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFI35P80217 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms