Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms