Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P63132 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms