Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS28P62857 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS28P62857 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS28P62857 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms