Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTBP60709 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTBP60709 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms