Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL2P60520 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL2P60520 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms