Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms