Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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FAM3BP58499 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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