Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK1P57059 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK1P57059 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms