Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP9P55211 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP9P55211 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP9P55211 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms