Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YARSP54577 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YARSP54577 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YARSP54577 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YARSP54577 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YARSP54577 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YARSP54577 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YARSP54577 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YARSP54577 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms