Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOSBP53539 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOSBP53539 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOSBP53539 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOSBP53539 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOSBP53539 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOSBP53539 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms