Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LUMP51884 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LUMP51884 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LUMP51884 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms