Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCN6P51797 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms