Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms