Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU3F4P49335 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms