Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMTP48728 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMTP48728 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms