Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REG1BP48304 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
REG1BP48304 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
REG1BP48304 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REG1BP48304 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REG1BP48304 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms