Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA8P48165 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA8P48165 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA8P48165 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA8P48165 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA8P48165 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA8P48165 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA8P48165 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms