Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGIRP43119 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms