Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A1P43005 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms