Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THPOP40225 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THPOP40225 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THPOP40225 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THPOP40225 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THPOP40225 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms