Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RTG3YBL103C 1461 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 URM1YIL008W 300 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YBL077WYBL077W 432 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 SPR3YGR059W 1539 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 ACA1YER045C 1470 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 MLH3YPL164C 2148 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 ESC2YDR363W 1371 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RNH202YDR279W 1053 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 MPD1YOR288C 957 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 PIN3YPR154W 648 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 DPB3YBR278W 606 nt0.94□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 MNL2YLR057W 2550 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YRO2YBR054W 1035 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YPL238CYPL238C 390 nt0.93□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YNR066CYNR066C 1311 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 POL4YCR014C 1749 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 FMN1YDR236C 657 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 PHO92YDR374C 921 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YGR190CYGR190C 366 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 GPN3YLR243W 819 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YLR400WYLR400W 474 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 HHT2YNL031C 411 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 BST1YFL025C 3090 nt0.92□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 UBC5YDR059C 447 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RPL16AYIL133C 600 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 APC2YLR127C 2562 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YDR018CYDR018C 1191 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 BNA7YDR428C 786 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 LRS4YDR439W 1044 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RPL37BYDR500C 267 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YGR064WYGR064W 369 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 SPO12YHR152W 522 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YCS4YLR272C 3531 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YMR144WYMR144W 1029 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 CCL1YPR025C 1182 nt0.91□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.9□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 CLB5YPR120C 1308 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 YOR203WYOR203W 354 nt0.9□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 GCD2YGR083C 1956 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 RKR1YMR247C 4689 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 PBP4YDL053C 558 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 GTR2YGR163W 1026 nt0.89□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 YMR31YFR049W 372 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 ACB1YGR037C 264 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 SPO77YLR341W 1434 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 DAL5YJR152W 1632 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 RRP6YOR001W 2202 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 AIM6YDL237W 1173 nt0.88□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 PRK1YIL095W 2433 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 APC5YOR249C 2058 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 GLC7YER133W 939 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 YLR379WYLR379W 375 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 PUF4YGL014W 2667 nt0.87□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 EST2YLR318W 2655 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 PPN1YDR452W 2025 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 LTO1YNL260C 597 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 NCL1YBL024W 2055 nt0.86□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 CKA1YIL035C 1119 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 RSA3YLR221C 663 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 CTK3YML112W 891 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 ATG5YPL149W 885 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 SLF1YDR515W 1344 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 STB4YMR019W 2850 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 FUS1YCL027W 1539 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 COG8YML071C 1824 nt0.85□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.84□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 FCF2YLR051C 654 nt0.84□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 IFH1YLR223C 3258 nt0.84□□□□□ -2.27
YRF1-2P40105 SHR3YDL212W 633 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 HLR1YDR528W 1272 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 RGI2YIL057C 495 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 BAG7YOR134W 1230 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 LTP1YPR073C 486 nt0.84□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YJR029WYJR029W 5268 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 SNC1YAL030W 354 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 RPA12YJR063W 378 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 HSE1YHL002W 1359 nt0.83□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 CTL1YMR180C 963 nt0.82□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 PFK27YOL136C 1194 nt0.82□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 BTT1YDR252W 450 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 UBX4YMR067C 1251 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 RMD5YDR255C 1266 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YJL169WYJL169W 369 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 PEX27YOR193W 1131 nt0.81□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 MUM3YOR298W 1440 nt0.8□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 WAR1YML076C 2835 nt0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 161.9 ms